132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2427 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  51.77 
 
 		 297 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  47.26 
 
 		 336 aa  298  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  41.34 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  39.01 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  36.36 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.35 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.55 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  33.59 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  33.21 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  34.28 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.32 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  33.62 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  31.22 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  31.49 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  29.91 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  29.02 
 
 		 321 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  31.91 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  28 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  29.17 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  29.79 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.33 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.13 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  29.49 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  29.59 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  31.49 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  28.51 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  30.17 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.94 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.94 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  29.44 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  28.94 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  26.03 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  27.17 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  29.77 
 
 		 584 aa  89  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  28.51 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.51 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  25.53 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  26.81 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.31 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  27.16 
 
 		 341 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.09 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  27.16 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  26.28 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  30.21 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  28.94 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  29.76 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  28.94 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.97 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  30.21 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  31.28 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  30.13 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  26.89 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  27.23 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  25.63 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  28.51 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.83 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  28.27 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  27.56 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  25 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  26.36 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  26.19 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  24.89 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  26.47 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  25.93 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  27.6 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.66 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  27.19 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  25.86 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  25.53 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  26.01 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  29.73 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  23 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  26.03 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  24.52 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  28.45 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  26.46 
 
 		 640 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  26.29 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  25.43 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  26.88 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.61 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  23.46 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1270  hypothetical protein  21.88 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  28.89 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  22.75 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  26.02 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  25.69 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.27 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  25.11 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  24.11 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.39 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>