110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2404 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1770  transposase, IS4 family protein  88.75 
 
 
391 aa  725    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0715373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1828  transposase, IS4 family protein  88.32 
 
 
351 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2500  transposase, IS4 family protein  88.32 
 
 
351 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2618  transposase, IS4 family protein  88.32 
 
 
351 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2717  transposase, IS4 family protein  88.32 
 
 
351 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3356  transposase, IS4 family protein  88.32 
 
 
351 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0139  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0245  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0443  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1491  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1777  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.395262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2404  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2461  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2563  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000574732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2676  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2886  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
391 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0242  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0319138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0450  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1554  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1673  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2970  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3616  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4101  transposase IS4 family protein  60 
 
 
394 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0117  transposase IS4 family protein  58.61 
 
 
387 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3426  transposase IS4 family protein  58.61 
 
 
387 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3925  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0872  transposase, IS4 family protein  29.15 
 
 
413 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0884  transposase, IS4 family protein  29.15 
 
 
413 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1795  transposase, IS4 family protein  29.15 
 
 
413 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0862  transposase, IS4 family protein  27.68 
 
 
413 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0291  transposase, IS4 family protein  27.38 
 
 
413 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2749  transposase, IS4 family protein  27.38 
 
 
413 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2754  transposase, IS4 family protein  27.38 
 
 
413 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2900  transposase IS4 family protein  28.65 
 
 
381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00460334  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0509  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 
381 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772109  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0552  transposase IS4 family protein  28.74 
 
 
381 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0870  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 
381 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100589  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3996  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
414 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  29.84 
 
 
389 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4657  transposase IS4 family protein  34.63 
 
 
414 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  28.52 
 
 
389 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  30.38 
 
 
372 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  30.38 
 
 
372 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  30.38 
 
 
372 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  30.38 
 
 
372 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  30.38 
 
 
362 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  32.7 
 
 
382 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1140  transposase IS4 family protein  33.48 
 
 
414 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000344199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2289  transposase IS4 family protein  33.48 
 
 
414 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000925206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2744  transposase IS4 family protein  33.48 
 
 
414 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000679967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3568  transposase IS4 family protein  33.48 
 
 
414 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1952  transposase IS4 family protein  31.98 
 
 
414 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3407  transposase IS4 family protein  31.98 
 
 
414 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000111807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  29.1 
 
 
376 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  33.18 
 
 
389 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  31.38 
 
 
389 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  31.06 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  31.13 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  31.78 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  30.33 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  30.33 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0980  transposase IS4 family protein  32.84 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000144163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  29.73 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0015  transposase, IS4 family protein  27.57 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1261  ISPg4, transposase  24.93 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0019  ISPg4 transposase  24.93 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.808263 
 
 
-
 
NC_002950  PG1673  ISPg4, transposase  24.93 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.185706 
 
 
-
 
NC_002950  PG0050  ISPg4, transposase  24.93 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2194  ISPg4, transposase  24.93 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0177  ISPg4, transposase  27.36 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0225  ISPg4, transposase  27.36 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0487  ISPg4, transposase  27.36 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0970  ISPg4, transposase  27.36 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.309605 
 
 
-
 
NC_002950  PG1658  ISPg4, transposase  27.36 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.198314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3633  transposase IS4 family protein  25 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3382  transposase IS4 family protein  25.35 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3846  transposase IS4 family protein  25.35 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0261  transposase IS4  24.32 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3153  transposase IS4  24.32 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0912286  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4497  transposase IS4 family protein  25.35 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2576  transposase IS4  25.35 
 
 
439 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2344  transposase IS4 family protein  26.83 
 
 
261 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.718047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5490  transposase IS4 family protein  20.2 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4418  transposase IS4 family protein  20.2 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000316762  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5869  transposase IS4 family protein  20.2 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5316  transposase IS4 family protein  19.87 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6486  transposase IS4 family protein  19.87 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4154  transposase IS4 family protein  19.87 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4150  transposase IS4 family protein  19.87 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.277384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3953  transposase IS4 family protein  19.87 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3686  transposase IS4 family protein  19.87 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>