More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2365 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  100 
 
 
282 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  71.63 
 
 
282 aa  416  1e-115  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  67.8 
 
 
283 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  56.69 
 
 
268 aa  326  2e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  57.25 
 
 
268 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  45.66 
 
 
269 aa  253  4e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  52.29 
 
 
282 aa  251  9e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  43.38 
 
 
281 aa  238  7e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  43.37 
 
 
268 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  44.66 
 
 
268 aa  220  2e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.68 
 
 
379 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.4 
 
 
388 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.62 
 
 
387 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.46 
 
 
362 aa  115  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.66 
 
 
277 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.84 
 
 
347 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.78188e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  26.46 
 
 
333 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.11 
 
 
576 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.35 
 
 
264 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.71 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  26.41 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.79 
 
 
897 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.28 
 
 
1055 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
210 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  29.54 
 
 
992 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  40.87 
 
 
192 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  27.44 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  40.87 
 
 
192 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  40.87 
 
 
192 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  32.78 
 
 
208 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  25.35 
 
 
270 aa  85.1  1e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.88 
 
 
373 aa  84.3  2e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.57 
 
 
317 aa  84  2e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  24.82 
 
 
281 aa  84  2e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.24 
 
 
830 aa  84.7  2e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  24.02 
 
 
753 aa  83.2  4e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.64 
 
 
209 aa  82.8  5e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.05 
 
 
869 aa  82.4  8e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  25.66 
 
 
922 aa  82  9e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  24.32 
 
 
869 aa  82  9e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.49 
 
 
919 aa  81.6  1e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.71 
 
 
834 aa  81.6  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  27.23 
 
 
352 aa  81.6  1e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  31.21 
 
 
208 aa  80.9  2e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  23.85 
 
 
948 aa  81.3  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  25 
 
 
377 aa  80.9  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  23.76 
 
 
264 aa  80.9  2e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.41 
 
 
920 aa  80.5  3e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  23.53 
 
 
828 aa  80.1  3e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.15 
 
 
910 aa  80.1  4e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  26.64 
 
 
351 aa  79.7  5e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.72 
 
 
828 aa  79.7  5e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.51 
 
 
833 aa  79.3  6e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  27.94 
 
 
377 aa  79.3  7e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.51 
 
 
378 aa  79  8e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.97973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  36.25 
 
 
184 aa  79  8e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  24.63 
 
 
431 aa  79  9e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
478 aa  78.2  1e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  28.86 
 
 
936 aa  78.2  1e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  41.12 
 
 
205 aa  78.6  1e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.83 
 
 
212 aa  78.6  1e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  26.1 
 
 
268 aa  78.2  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
208 aa  78.6  1e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
193 aa  78.6  1e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.35 
 
 
852 aa  77.4  2e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  2e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  28.32 
 
 
207 aa  77.4  2e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
213 aa  78.2  2e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  2e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  27.34 
 
 
992 aa  77.4  2e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  28.5 
 
 
379 aa  77.8  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  24.06 
 
 
919 aa  77  3e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.65 
 
 
229 aa  77.4  3e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.13 
 
 
429 aa  77.4  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  28.76 
 
 
952 aa  77  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.36 
 
 
830 aa  76.6  4e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.33 
 
 
375 aa  76.6  4e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.51 
 
 
386 aa  76.6  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.13 
 
 
429 aa  76.3  6e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.05 
 
 
386 aa  75.9  6e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  27.84 
 
 
1070 aa  75.9  6e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  25.93 
 
 
781 aa  76.3  6e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.05 
 
 
386 aa  75.9  7e-13  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.05 
 
 
379 aa  75.9  7e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.05 
 
 
379 aa  75.9  7e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  24.91 
 
 
803 aa  75.9  7e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.05 
 
 
379 aa  75.9  7e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  23.51 
 
 
912 aa  75.9  7e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  75.9  7e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  24.32 
 
 
386 aa  75.9  7e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  31.15 
 
 
227 aa  75.5  8e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  41.57 
 
 
206 aa  75.5  8e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  26.26 
 
 
823 aa  75.9  8e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.48 
 
 
378 aa  75.5  9e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
921 aa  75.5  9e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  26.09 
 
 
379 aa  75.5  9e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>