More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2345 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
323 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
320 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
321 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  38.07 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 
373 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.95 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
318 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
398 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
310 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
303 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
349 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
302 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 
295 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
313 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
321 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
294 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
581 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
380 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
305 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
331 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
1035 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
337 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
672 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  34.05 
 
 
341 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
235 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
289 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
597 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
330 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
397 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
390 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
333 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
344 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
390 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.41 
 
 
326 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.41 
 
 
326 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
337 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.89 
 
 
326 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.05 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
450 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
300 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
325 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
347 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
1032 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
325 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.8 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.09 
 
 
324 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
333 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
847 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
347 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
289 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
361 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
655 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
301 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
327 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
363 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
544 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
357 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
310 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
323 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
230 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
349 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
303 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
280 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
366 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  31.3 
 
 
325 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
249 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
584 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
326 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  43.44 
 
 
379 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
351 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
262 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
746 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
347 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
365 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
283 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
316 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>