More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2302 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 324 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.38 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 		 408 aa  300  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  46.58 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.37 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.61 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.24 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  45.68 
 
 		 325 aa  288  9e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.67 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.06 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.37 
 
 		 346 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.91 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.54 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.28 
 
 		 336 aa  285  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 		 593 aa  284  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.21 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.94 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.35 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  43.71 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.18 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.91 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.67 
 
 		 358 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.07 
 
 		 341 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  44.84 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.21 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.37 
 
 		 336 aa  278  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  44.84 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.03 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 		 323 aa  278  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 335 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.69 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  42.99 
 
 		 336 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.54 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.06 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.41 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.45 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.74 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.1 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.88 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  44.21 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.18 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.74 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.06 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.91 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.14 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.28 
 
 		 336 aa  272  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.05 
 
 		 335 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.64 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  43.45 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.96 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.41 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  44.58 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.98 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0430992  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.11 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  43.11 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  42.51 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.24 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 337 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.75 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  43.15 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  41.42 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  42.94 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.62 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.31 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 		 336 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.56 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.11 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.34 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>