More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2243 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  62.98 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  60.42 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  62.13 
 
 		 239 aa  294  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  62.18 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  58.58 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  56.54 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  46.64 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  41.99 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.22 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  45.35 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  41.38 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  44.07 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  39.13 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  38.39 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  46.55 
 
 		 212 aa  142  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  39.22 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  39.13 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  39.13 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  36.59 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 		 242 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.8 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  37.74 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  36.84 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  37.31 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  42 
 
 		 186 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  38.73 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  29.19 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  42.67 
 
 		 186 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  39.61 
 
 		 190 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  34.93 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  31.82 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  35.89 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  33.8 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.74 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  34.4 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  33.81 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 		 224 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.81 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  38.07 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  35.58 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  32.7 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  35.75 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  39.25 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  31.9 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  36.89 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  36.89 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  34.45 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  31.16 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  34.95 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  29.71 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  34.39 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  31.55 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  30.28 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  33.68 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  31.13 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  32.51 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  36.95 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  36.81 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  36.05 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  33.84 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  36.41 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  32.6 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  35.43 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  33.48 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>