129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2234 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  59.45 
 
 
281 aa  299  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  58.27 
 
 
392 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  54.61 
 
 
272 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.6 
 
 
294 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.08 
 
 
294 aa  215  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.97 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.97 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0823  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.53 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  37.1 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.67 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.73 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11398  Phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  29.24 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.924537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.88 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  39.17 
 
 
185 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.3 
 
 
171 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  38.71 
 
 
185 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.69 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.343717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.88 
 
 
185 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.73 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.38 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.57 
 
 
180 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.2 
 
 
177 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.08 
 
 
204 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.7 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.08 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  34.69 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.44 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.61 
 
 
179 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  21.82 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.51 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  38.89 
 
 
175 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  33.06 
 
 
175 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.67 
 
 
181 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.49 
 
 
205 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  30.27 
 
 
445 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.88 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  36.26 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2916  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.21 
 
 
274 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.65 
 
 
438 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.45 
 
 
198 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.71 
 
 
194 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  36.46 
 
 
108 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  34 
 
 
242 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.36 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.1 
 
 
175 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.1 
 
 
175 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.19 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.35 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.1 
 
 
175 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.88 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2826  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.07 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.45 
 
 
178 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.12 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.29 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.04 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.76 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  32.58 
 
 
187 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.86 
 
 
166 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3918  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related (membrane associated)  39.62 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.45 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
174 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
174 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
174 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  29.85 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
174 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  31.68 
 
 
1261 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.81 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.93 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.2 
 
 
442 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.87 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0562  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.51 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0152242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.25 
 
 
168 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0559  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.51 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  33.93 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2216  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.94 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.83 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1377  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.9 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.14 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3153  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.48 
 
 
195 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0111144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.34 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.7 
 
 
208 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.79 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.03 
 
 
182 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.3 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0530  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.26 
 
 
199 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126296  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.62 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1306  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.83 
 
 
225 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.420289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.92 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  28.48 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  28.48 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  25.93 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  36.26 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.19 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.43 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.33 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>