More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2231 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  52.67 
 
 
241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  51.85 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  42.4 
 
 
252 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  44.53 
 
 
273 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  43.62 
 
 
240 aa  197  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  42.29 
 
 
285 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  55.17 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  55.17 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  49.61 
 
 
301 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  56.6 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  56.25 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  57.39 
 
 
251 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  56.36 
 
 
184 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  44.37 
 
 
192 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.59 
 
 
243 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.76 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.03 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  44.83 
 
 
388 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.14 
 
 
411 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.76 
 
 
238 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.56 
 
 
274 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  45.24 
 
 
369 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  55.08 
 
 
194 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  39 
 
 
374 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  47.75 
 
 
610 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.24 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.39 
 
 
430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
590 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  44.09 
 
 
318 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.45 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  48.74 
 
 
446 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  51.3 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.07 
 
 
400 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.68 
 
 
452 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  48.41 
 
 
824 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  50 
 
 
309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  50.85 
 
 
367 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.33 
 
 
751 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  48.7 
 
 
324 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  49.55 
 
 
605 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  46.46 
 
 
310 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  42.98 
 
 
307 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.01 
 
 
375 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  42.52 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  49.12 
 
 
377 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  47.15 
 
 
442 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  50 
 
 
582 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.25 
 
 
376 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  49.59 
 
 
419 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  41.13 
 
 
299 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  48.21 
 
 
541 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  46.34 
 
 
299 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  46.73 
 
 
216 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  48.18 
 
 
315 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.55 
 
 
299 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  47.69 
 
 
386 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  47.69 
 
 
386 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  50.47 
 
 
402 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  37.42 
 
 
404 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  43.97 
 
 
363 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  50.44 
 
 
727 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  50 
 
 
468 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  50.44 
 
 
727 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  45.45 
 
 
412 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.3 
 
 
303 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  41.13 
 
 
299 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  46.67 
 
 
517 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  50.46 
 
 
523 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  46.51 
 
 
305 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  48.7 
 
 
328 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.28 
 
 
372 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  47.46 
 
 
465 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.38 
 
 
304 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  40.48 
 
 
459 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  52.21 
 
 
379 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  48.15 
 
 
384 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  45.3 
 
 
430 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  43.92 
 
 
351 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  30.56 
 
 
249 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  48.65 
 
 
294 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  46.92 
 
 
386 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.74 
 
 
374 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.57 
 
 
265 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.9 
 
 
440 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40.65 
 
 
527 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  47.75 
 
 
292 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  47.79 
 
 
375 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  39.51 
 
 
475 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  39.51 
 
 
473 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40.43 
 
 
299 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  42.42 
 
 
529 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  40.43 
 
 
299 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.85 
 
 
314 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.64 
 
 
402 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  47.71 
 
 
334 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  40.43 
 
 
299 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  47.24 
 
 
349 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.11 
 
 
387 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  40.79 
 
 
230 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>