74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2132 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  87.41 
 
 		 143 aa  254  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  83.22 
 
 		 143 aa  243  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  82.52 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  84.62 
 
 		 143 aa  241  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  81.12 
 
 		 143 aa  236  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  81.12 
 
 		 143 aa  231  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.01 
 
 		 170 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.93 
 
 		 143 aa  203  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  68.31 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  67.83 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  65.49 
 
 		 143 aa  197  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  67.13 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  64.34 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  61.27 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  59.44 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  58.74 
 
 		 143 aa  173  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.34 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  59.44 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.45 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  55.94 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  56.64 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  53.57 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  53.85 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  52.82 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.59 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.6 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  44.06 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.81 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.76 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  44.14 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  42.66 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.06 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  43.48 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.41 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  41.67 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  42.36 
 
 		 142 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  38.3 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.37 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  39.86 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  40.43 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  40.29 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  47.2 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.41 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.36 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  42.45 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  44.44 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  39.01 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  39.52 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  38.71 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  37.9 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  33.82 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  34.33 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  35.58 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  38 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  37 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.58 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  36 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.54 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  37.82 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  30.3 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  26.09 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.02 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  24.24 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.45 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  41.2  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  38 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>