More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2124 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  87.04 
 
 		 433 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  84.92 
 
 		 433 aa  777    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  85.19 
 
 		 433 aa  760    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 434 aa  902    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  85.38 
 
 		 433 aa  779    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  84.22 
 
 		 436 aa  771    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  86.31 
 
 		 435 aa  786    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  61.63 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  59.16 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  59.16 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  59.16 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  59.4 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  60.37 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  60 
 
 		 439 aa  557  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  59.3 
 
 		 433 aa  554  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  59.3 
 
 		 432 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  59.07 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  57.18 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  57.64 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  58.97 
 
 		 433 aa  544  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  59.08 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  57.77 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  60.42 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  57.91 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  58.47 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  61.02 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  58.1 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  58.29 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  57.08 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  57.44 
 
 		 435 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.41 
 
 		 432 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  58.14 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  57.91 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  56.38 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  57.83 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  57.44 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  57.44 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  56.98 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 		 433 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  56.38 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  56.18 
 
 		 430 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  60.23 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  55.81 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  56.02 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  57.08 
 
 		 438 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  54.29 
 
 		 446 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  56.02 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  53.36 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  56.74 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.27 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  54.52 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  52.57 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.35 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  52.19 
 
 		 439 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  52.89 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  51.27 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  51.3 
 
 		 423 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  53.35 
 
 		 437 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  53.65 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  51.15 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  53.41 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  52.38 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  53.41 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  52.93 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  51.04 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  53.65 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  51.63 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  52.39 
 
 		 444 aa  458  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  52.73 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  51.42 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  51.42 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  51.29 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  51.42 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  52.47 
 
 		 434 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  51.05 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  52.21 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  51.41 
 
 		 434 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  52.84 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.65 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  53.08 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  53.08 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  53.08 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  54.1 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  50.47 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  51.28 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  51.53 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  51.89 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  52.11 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  52 
 
 		 432 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  49.89 
 
 		 434 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  51.67 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>