34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2113 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1326    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1914  hypothetical protein  24.38 
 
 		 504 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0894751  normal  0.0101987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1178  hypothetical protein  22.47 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.578023  normal  0.643393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3211  hypothetical protein  26.13 
 
 		 514 aa  94.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.506574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1756  hypothetical protein  21.53 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1125  hypothetical protein  26.81 
 
 		 503 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  normal  0.698943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2695  hypothetical protein  21.78 
 
 		 527 aa  89  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0785  hypothetical protein  25.25 
 
 		 497 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3128  hypothetical protein  23.63 
 
 		 482 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3759  hypothetical protein  27.85 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622356  unclonable  0.0000207551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2252  hypothetical protein  26.4 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0780  hypothetical protein  22.08 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0567586  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1959  hypothetical protein  24.36 
 
 		 496 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0740  hypothetical protein  26.24 
 
 		 484 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0341135  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2439  hypothetical protein  24.44 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0189  hypothetical protein  22.82 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0739  hypothetical protein  24.23 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0238629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3427  hypothetical protein  30.23 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2578  hypothetical protein  22.11 
 
 		 493 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0961  hypothetical protein  22.37 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0766  hypothetical protein  25.1 
 
 		 477 aa  52.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6220  hypothetical protein  22.98 
 
 		 493 aa  52.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1027  hypothetical protein  22.49 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 643 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4091  hypothetical protein  24.42 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2907  hypothetical protein  26.28 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0384009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3960  hypothetical protein  24.91 
 
 		 540 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1716  hypothetical protein  24.75 
 
 		 322 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2208  hypothetical protein  25.48 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.11 
 
 		 1764 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  41.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  41.43 
 
 		 366 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.07 
 
 		 294 aa  43.9  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>