More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2065 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
359 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  66.57 
 
 
360 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  68.08 
 
 
364 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  61.28 
 
 
362 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  60.17 
 
 
362 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  60.06 
 
 
366 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  62.46 
 
 
369 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 
484 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  38.96 
 
 
342 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 
369 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  31.27 
 
 
361 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 
376 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 
345 aa  149  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.11 
 
 
366 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  40.88 
 
 
636 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  40.88 
 
 
636 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0689  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1409  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 
351 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 
358 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 
378 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2479  MscS Mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.827266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  37.09 
 
 
1111 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.42 
 
 
291 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  29.07 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 
843 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  30.81 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 
637 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  28.95 
 
 
351 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1267  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 
351 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 
330 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 
298 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 
685 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  27.18 
 
 
348 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
336 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  29.13 
 
 
289 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
275 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  31.12 
 
 
451 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 
362 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 
304 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  31.25 
 
 
451 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 
299 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 
840 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 
352 aa  123  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 
842 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 
795 aa  122  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 
270 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  27.73 
 
 
373 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  36.59 
 
 
1117 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  35.41 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 
864 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
874 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  36.76 
 
 
1118 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  36.59 
 
 
1134 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  36.76 
 
 
1120 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  32.92 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  36.76 
 
 
1118 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  37.3 
 
 
1115 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  36.76 
 
 
1118 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  36.76 
 
 
1120 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 
305 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 
460 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  36.59 
 
 
1134 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 
305 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.49 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.92 
 
 
450 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  32.5 
 
 
450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  35.96 
 
 
1102 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.23 
 
 
806 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 
752 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 
1166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.5 
 
 
450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  37.3 
 
 
1133 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.5 
 
 
450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.5 
 
 
450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  32.5 
 
 
449 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 
344 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  35.96 
 
 
1102 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  32.5 
 
 
449 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 
447 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 
322 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 
784 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.23 
 
 
844 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>