More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2050 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
325 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  83.02 
 
 
333 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.48 
 
 
326 aa  544  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.48 
 
 
326 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  81.48 
 
 
326 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.62 
 
 
325 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.54 
 
 
324 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  65.63 
 
 
324 aa  441  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.91 
 
 
343 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.416644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.37 
 
 
339 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  60.25 
 
 
343 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.29 
 
 
344 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.55 
 
 
339 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.94 
 
 
332 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.03 
 
 
321 aa  296  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 
321 aa  295  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
321 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
321 aa  293  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
321 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  44.89 
 
 
321 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  44.58 
 
 
321 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
306 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 
312 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
349 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
349 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
319 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
321 aa  255  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
321 aa  255  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
319 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
319 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
331 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.93 
 
 
318 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
338 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
358 aa  248  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 
316 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1749  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.81 
 
 
319 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.258906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
307 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0267  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
318 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  40.99 
 
 
318 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
316 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000461837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  37.23 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  36.62 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.77 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
334 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
316 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
318 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  40.99 
 
 
318 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.99 
 
 
318 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
318 aa  242  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
318 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 
320 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
316 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  42.94 
 
 
336 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
316 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
309 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  40.06 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  36.62 
 
 
316 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.62 
 
 
316 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.55 
 
 
321 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
322 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.93 
 
 
326 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
319 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.93 
 
 
319 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
334 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.93 
 
 
345 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000495045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
316 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  37.03 
 
 
342 aa  235  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
336 aa  235  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  38.46 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5300  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  40.12 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  39.17 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.93 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
334 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0219  oligopeptide ABC transporter permease  40.84 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  42.37 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0242  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
313 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  41.1 
 
 
318 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
325 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26218  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
320 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  39.2 
 
 
314 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  37.43 
 
 
341 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
332 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  37.43 
 
 
341 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
313 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  40 
 
 
313 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
336 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>