More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2040 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  77.46 
 
 
432 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
432 aa  861    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  66.92 
 
 
408 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  62.13 
 
 
418 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  61.06 
 
 
415 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  53.44 
 
 
415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  48.45 
 
 
432 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  44.42 
 
 
452 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  49.01 
 
 
438 aa  360  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  34.98 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  35.39 
 
 
421 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  36.86 
 
 
421 aa  237  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  36.63 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  34.78 
 
 
422 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  33.84 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  33.91 
 
 
544 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  31.18 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  36.36 
 
 
527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  33.89 
 
 
565 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 
420 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  31.86 
 
 
542 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  33.99 
 
 
547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  34.63 
 
 
448 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  32.43 
 
 
554 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  29.34 
 
 
430 aa  183  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  33.79 
 
 
419 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  32.67 
 
 
412 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  31.51 
 
 
456 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  33 
 
 
547 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  33.5 
 
 
547 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  33.42 
 
 
547 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  31.59 
 
 
552 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  33.42 
 
 
547 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  32.59 
 
 
547 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  31.39 
 
 
448 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  33 
 
 
547 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  29.37 
 
 
438 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  31.87 
 
 
557 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  32.36 
 
 
557 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  32.36 
 
 
557 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  32.76 
 
 
547 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  32.28 
 
 
590 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  31.55 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  30.95 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  30.55 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  31.54 
 
 
565 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  30.32 
 
 
548 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  30.32 
 
 
548 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  31.08 
 
 
553 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  30.73 
 
 
548 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  30.32 
 
 
548 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  32.28 
 
 
547 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 
428 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  28.16 
 
 
430 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  28.16 
 
 
430 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  27.92 
 
 
430 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  33.81 
 
 
431 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  29.85 
 
 
456 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  29.85 
 
 
456 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  31.78 
 
 
644 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  27.88 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  30.21 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  29.28 
 
 
429 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  29.28 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  32.36 
 
 
558 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  31.97 
 
 
591 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  36.48 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  30.31 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  30.34 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  30.31 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  32.12 
 
 
552 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  29.78 
 
 
428 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  29.9 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  31.27 
 
 
432 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  31.51 
 
 
401 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  29.1 
 
 
420 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  29.58 
 
 
423 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 
423 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 
423 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  28.22 
 
 
434 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  29.62 
 
 
435 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  28.16 
 
 
433 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  30.83 
 
 
557 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  28.8 
 
 
421 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  28.8 
 
 
421 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  29.35 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  27.94 
 
 
429 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  32.81 
 
 
413 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  28.4 
 
 
444 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  29.41 
 
 
423 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  31.27 
 
 
403 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  30.58 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  31 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  31.25 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  29.51 
 
 
406 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  28.65 
 
 
415 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  29.06 
 
 
433 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  28.04 
 
 
418 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 
422 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  27.66 
 
 
448 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>