152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2036 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  47.14 
 
 		 3507 aa  1135    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  47.8 
 
 		 4433 aa  1079    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 2068 aa  4123    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  32.18 
 
 		 2286 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  35.14 
 
 		 485 aa  160  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.02 
 
 		 480 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  35.64 
 
 		 471 aa  148  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  36.49 
 
 		 463 aa  143  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  32.86 
 
 		 436 aa  138  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  34.62 
 
 		 456 aa  135  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.26 
 
 		 1042 aa  128  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 		 3333 aa  127  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  25.78 
 
 		 9585 aa  122  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  30.26 
 
 		 439 aa  118  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.32 
 
 		 779 aa  117  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  29.6 
 
 		 450 aa  106  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  60 
 
 		 340 aa  105  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  30.42 
 
 		 480 aa  101  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  30.99 
 
 		 491 aa  101  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  29.74 
 
 		 400 aa  98.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.14 
 
 		 1272 aa  95.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  51.55 
 
 		 409 aa  94  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  30.03 
 
 		 403 aa  90.1  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  87.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  27.21 
 
 		 1973 aa  87  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.75 
 
 		 391 aa  87.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.65 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 771 aa  80.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  32.54 
 
 		 692 aa  79.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  30.63 
 
 		 1247 aa  79.3  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  30.16 
 
 		 430 aa  78.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  26.9 
 
 		 841 aa  78.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.75 
 
 		 795 aa  77.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  22.69 
 
 		 680 aa  75.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  46.15 
 
 		 527 aa  74.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  25.84 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  29.14 
 
 		 1248 aa  72.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  28.84 
 
 		 1363 aa  70.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  29.96 
 
 		 404 aa  70.5  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.63 
 
 		 1067 aa  70.1  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  27.89 
 
 		 836 aa  70.1  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  29.64 
 
 		 670 aa  70.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  37.82 
 
 		 995 aa  69.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  25.14 
 
 		 1380 aa  68.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.72 
 
 		 2198 aa  67.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  34.86 
 
 		 683 aa  67.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.24 
 
 		 741 aa  68.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  31.58 
 
 		 1113 aa  67  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.56 
 
 		 803 aa  66.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.81 
 
 		 1735 aa  66.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.11 
 
 		 1363 aa  66.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  41.24 
 
 		 2334 aa  65.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1062 aa  65.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.48 
 
 		 903 aa  65.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.79 
 
 		 501 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  31.43 
 
 		 801 aa  64.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  24.81 
 
 		 864 aa  63.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  25.25 
 
 		 408 aa  64.3  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.93 
 
 		 1848 aa  63.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  31.32 
 
 		 656 aa  63.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.4 
 
 		 1628 aa  63.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  29.9 
 
 		 999 aa  63.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.91 
 
 		 378 aa  63.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  30.88 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  25.36 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  32.11 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  27.2 
 
 		 1633 aa  62.4  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  28.81 
 
 		 701 aa  62  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  27.02 
 
 		 404 aa  61.6  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  36.36 
 
 		 490 aa  61.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  31.23 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  37.65 
 
 		 853 aa  58.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.63 
 
 		 6885 aa  58.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  33.56 
 
 		 861 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  41.57 
 
 		 14944 aa  58.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.12 
 
 		 649 aa  57.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  29.95 
 
 		 1695 aa  57.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.05 
 
 		 1531 aa  57  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  30.48 
 
 		 674 aa  57  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1521  hypothetical protein  40.32 
 
 		 492 aa  56.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812008  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  27.72 
 
 		 460 aa  57  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  56.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  33.88 
 
 		 1377 aa  55.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.87 
 
 		 870 aa  55.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  25.38 
 
 		 626 aa  55.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.65 
 
 		 1160 aa  55.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  23.3 
 
 		 761 aa  55.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  27.85 
 
 		 2170 aa  55.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.82 
 
 		 3802 aa  54.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  28.64 
 
 		 1065 aa  55.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 673 aa  54.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  27.88 
 
 		 918 aa  53.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  30 
 
 		 715 aa  54.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  27.62 
 
 		 1199 aa  53.5  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  22.41 
 
 		 429 aa  53.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.61 
 
 		 528 aa  53.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  23.69 
 
 		 1795 aa  53.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  29.04 
 
 		 801 aa  53.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.66 
 
 		 648 aa  53.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>