More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1941 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
357 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  56.61 
 
 
373 aa  381  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
371 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  40.67 
 
 
366 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 
571 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  40.97 
 
 
719 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  37.03 
 
 
574 aa  245  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 
703 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 
703 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
565 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
718 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 
562 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
710 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  39.14 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
692 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 
770 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  35.06 
 
 
712 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.33 
 
 
880 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.33 
 
 
860 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
363 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
553 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  37.33 
 
 
550 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  41.49 
 
 
632 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
1237 aa  205  9e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  35.01 
 
 
548 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
571 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.87 
 
 
508 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.22 
 
 
491 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.74 
 
 
513 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
755 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
403 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.98 
 
 
502 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
526 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 
496 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
465 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  50.88 
 
 
960 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  49.46 
 
 
326 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  36.5 
 
 
547 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  36.5 
 
 
547 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  33.15 
 
 
619 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  47.57 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 
1171 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  50.59 
 
 
481 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  36.98 
 
 
407 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  33.54 
 
 
787 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  46.2 
 
 
792 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
387 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  34.8 
 
 
495 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.88 
 
 
841 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 
650 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  45.88 
 
 
836 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
407 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  50.28 
 
 
331 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 
498 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 
649 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 
1335 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  33.52 
 
 
848 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  46.45 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
647 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.52 
 
 
343 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 
647 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  37.66 
 
 
713 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  46.49 
 
 
518 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  43.96 
 
 
334 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 
339 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  49.71 
 
 
499 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 
833 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  45.65 
 
 
349 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.88 
 
 
394 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  45.65 
 
 
430 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 
698 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  39.48 
 
 
710 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  43.41 
 
 
334 aa  169  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  48.13 
 
 
248 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  44.66 
 
 
357 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.27 
 
 
357 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.27 
 
 
357 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  37.76 
 
 
561 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.37 
 
 
853 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 
611 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 
357 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
506 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
347 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 
212 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  42.94 
 
 
563 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 
247 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  44.07 
 
 
836 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  44.95 
 
 
298 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 
314 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.67 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  44.44 
 
 
599 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>