267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1912 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1912  patatin  100 
 
 		 282 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  48.72 
 
 		 284 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  45.79 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  29.43 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  29.55 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.26 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  27.62 
 
 		 321 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  26.92 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  26.92 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  26.92 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  26.92 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  26.92 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  26.92 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  31.74 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.53 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.2 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.13 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  22.45 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  27.62 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  23.51 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  27.27 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.44 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.44 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  28.99 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  28.42 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.94 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.34 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.65 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  27.23 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.34 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.42 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  27.57 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.34 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.03 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.89 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.89 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.89 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.89 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.89 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  28.5 
 
 		 358 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.34 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  29.14 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  27.98 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  29.14 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  26.5 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  27 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  26.99 
 
 		 798 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.86 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  29.58 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  24.9 
 
 		 728 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  20.86 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  29.34 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  24.81 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  26.79 
 
 		 796 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  30.86 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.4 
 
 		 751 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.4 
 
 		 728 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.14 
 
 		 728 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  27.93 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  31.07 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.14 
 
 		 727 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  27.93 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.23 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  24.18 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  28.57 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  30.17 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.32 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25.56 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  28.32 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.51 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.32 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  27.03 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.11 
 
 		 803 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.11 
 
 		 803 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  20.27 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  26.11 
 
 		 803 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.8 
 
 		 753 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  29 
 
 		 720 aa  65.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.05 
 
 		 813 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  26.98 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  28.88 
 
 		 738 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  28.92 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  29.44 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  29.3 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  34.09 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  26.35 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  28.64 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  30.53 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  27.11 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  28.65 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  29.48 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.94 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  25.95 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  23.27 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  24.71 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>