136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1909 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  81.25 
 
 
368 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  100 
 
 
368 aa  767    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  80.05 
 
 
367 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  79.51 
 
 
367 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  70.3 
 
 
367 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  70.96 
 
 
366 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  48.4 
 
 
371 aa  358  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1544  peptidase M29 aminopeptidase II  48.66 
 
 
371 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  48.27 
 
 
371 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  47.44 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  47.34 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  45.62 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  42.9 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  43.13 
 
 
370 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  45.07 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  45.07 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  45.07 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  45.07 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  45.07 
 
 
371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  45.07 
 
 
371 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  45.07 
 
 
371 aa  318  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  44.8 
 
 
371 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3002  peptidase M29 aminopeptidase II  45.36 
 
 
374 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0261294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4579  aminopeptidase  44.8 
 
 
371 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4933  aminopeptidase  44.8 
 
 
371 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  39.13 
 
 
388 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  42.86 
 
 
389 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  41.78 
 
 
369 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  41.24 
 
 
369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3265  peptidase M29, aminopeptidase II  46.46 
 
 
304 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  38.42 
 
 
367 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  37.26 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  36.14 
 
 
367 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  36.12 
 
 
368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  36.9 
 
 
375 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  36.9 
 
 
375 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  37.11 
 
 
380 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  36.59 
 
 
366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  36.04 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  35.89 
 
 
365 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  34.53 
 
 
388 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  34.53 
 
 
359 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  33.71 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  32.77 
 
 
357 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  34.81 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  31.25 
 
 
366 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  33.99 
 
 
370 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  33.06 
 
 
363 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  33.52 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  32.69 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  31.92 
 
 
352 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  33.16 
 
 
373 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3312  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like  29.04 
 
 
371 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.390308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  27.83 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  25.34 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  27.7 
 
 
417 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  25.71 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  26.96 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  26.96 
 
 
419 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  25.73 
 
 
409 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  25.67 
 
 
403 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  25.88 
 
 
419 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  28.23 
 
 
410 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  28.02 
 
 
418 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  26.29 
 
 
406 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  25.25 
 
 
418 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  25.74 
 
 
418 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1649  peptidase M29 aminopeptidase II  29.05 
 
 
410 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  25.97 
 
 
417 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  25.56 
 
 
410 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  26.15 
 
 
416 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  24.86 
 
 
409 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  27.32 
 
 
423 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  26.72 
 
 
417 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  25.13 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  28.45 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5302  peptidase M29 aminopeptidase II  25.06 
 
 
418 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0490677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  26.48 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  25.28 
 
 
409 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  25.71 
 
 
401 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  25.84 
 
 
423 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  26.43 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  24.57 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  23.88 
 
 
418 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  23.42 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  25.56 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  25.93 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  26.91 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  25.93 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  25.71 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  25.85 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  25.93 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  25.93 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  26.4 
 
 
411 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  25.63 
 
 
415 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  35.86 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  25.42 
 
 
409 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  25.44 
 
 
409 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  25.78 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  25.78 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>