More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1869 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  75.84 
 
 
714 aa  1095    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.44 
 
 
772 aa  1061    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.08 
 
 
717 aa  887    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  75.1 
 
 
767 aa  1182    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.02 
 
 
765 aa  1095    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
829 aa  1691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.07 
 
 
778 aa  1038    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.35 
 
 
772 aa  1076    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.83 
 
 
772 aa  619  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.69 
 
 
904 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 
904 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 
753 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.24 
 
 
700 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.02 
 
 
683 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  42.46 
 
 
818 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.34 
 
 
712 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.53 
 
 
740 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 
818 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.77 
 
 
817 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 
819 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.75 
 
 
842 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 
819 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.51 
 
 
685 aa  569  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.42 
 
 
908 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 
842 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.86 
 
 
689 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.79 
 
 
681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 
786 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.47 
 
 
693 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.95 
 
 
832 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 
818 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.6 
 
 
703 aa  552  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.15 
 
 
692 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.62 
 
 
862 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.92 
 
 
691 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.36 
 
 
691 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.88 
 
 
827 aa  554  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.67 
 
 
691 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 
779 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.79 
 
 
691 aa  552  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.85 
 
 
691 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.02 
 
 
685 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  48 
 
 
691 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.3 
 
 
692 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 
692 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.01 
 
 
686 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.13 
 
 
691 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.88 
 
 
694 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.01 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 
706 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 
706 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.05 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.95 
 
 
787 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.43 
 
 
689 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.81 
 
 
693 aa  538  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.59 
 
 
686 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 
815 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.22 
 
 
693 aa  538  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.74 
 
 
693 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.69 
 
 
691 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.93 
 
 
683 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 
702 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.05 
 
 
706 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.27 
 
 
704 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 
679 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.44 
 
 
707 aa  535  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 
690 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 
827 aa  531  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.22 
 
 
691 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.39 
 
 
691 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 
680 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.9 
 
 
697 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.24 
 
 
690 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.73 
 
 
696 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.3 
 
 
903 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 
693 aa  528  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.73 
 
 
691 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 
696 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.42 
 
 
719 aa  529  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.33 
 
 
696 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.79 
 
 
684 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.32 
 
 
690 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.55 
 
 
693 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 
781 aa  523  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.31 
 
 
693 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.58 
 
 
696 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.58 
 
 
696 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 
693 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.44 
 
 
697 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 
693 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 
693 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 
693 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 
712 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 
812 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.11 
 
 
693 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 
776 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 
693 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.11 
 
 
693 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.35 
 
 
693 aa  522  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 
693 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>