More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1831 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  77.07 
 
 
472 aa  764    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  78.13 
 
 
472 aa  773    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  70.49 
 
 
472 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
472 aa  958    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  81.74 
 
 
474 aa  802    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  82.38 
 
 
474 aa  809    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  68.64 
 
 
472 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  62 
 
 
473 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  51.7 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.71 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  45.3 
 
 
467 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  44.03 
 
 
470 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  44.03 
 
 
471 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  42.43 
 
 
467 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  44.35 
 
 
463 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  43.28 
 
 
486 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.16 
 
 
466 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  41.44 
 
 
488 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  42 
 
 
475 aa  364  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  42.15 
 
 
475 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.98 
 
 
469 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  40.86 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.13 
 
 
469 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  38.72 
 
 
468 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  40 
 
 
469 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.04 
 
 
484 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  40.3 
 
 
471 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.94 
 
 
469 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.29 
 
 
475 aa  316  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.15 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  38.51 
 
 
474 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.04 
 
 
464 aa  306  6e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  40.17 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  38.29 
 
 
503 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  39.01 
 
 
482 aa  296  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  35.89 
 
 
474 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  35.96 
 
 
457 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  35.73 
 
 
474 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.54 
 
 
470 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.2 
 
 
470 aa  282  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  35.94 
 
 
460 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  34.75 
 
 
470 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  36.38 
 
 
477 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  37.01 
 
 
473 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.84 
 
 
470 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  34.94 
 
 
501 aa  276  8e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.68 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  35.27 
 
 
733 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  34.26 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  33.82 
 
 
479 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  34.97 
 
 
458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  34.54 
 
 
460 aa  272  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  34.75 
 
 
460 aa  272  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.84 
 
 
460 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  35.24 
 
 
460 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  33.82 
 
 
486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.66 
 
 
475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  35.9 
 
 
460 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  33.82 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.82 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.44 
 
 
478 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  33.4 
 
 
486 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  36.19 
 
 
468 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  33.4 
 
 
490 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.16 
 
 
480 aa  260  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.06 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  32.64 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  35.4 
 
 
470 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  34.24 
 
 
467 aa  249  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  35.12 
 
 
409 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  35.12 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.62 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.43 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  31.54 
 
 
485 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  32.78 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  32.38 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  31.4 
 
 
484 aa  234  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  32.04 
 
 
484 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  31.62 
 
 
486 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  32.65 
 
 
487 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  33.68 
 
 
465 aa  220  5e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.54 
 
 
518 aa  219  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  34.22 
 
 
549 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  31.57 
 
 
548 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  33.33 
 
 
547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  32.29 
 
 
547 aa  197  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  31.18 
 
 
548 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  31.92 
 
 
557 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  33.33 
 
 
551 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  29.33 
 
 
548 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  32.11 
 
 
549 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.9 
 
 
576 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1922  phosphoglucomutase  30.77 
 
 
559 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  32.29 
 
 
548 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  34.29 
 
 
546 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  31.97 
 
 
548 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  29.86 
 
 
550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  31.59 
 
 
545 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  32.11 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  31.78 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>