More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1819 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  100 
 
 		 169 aa  341  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  63.25 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  56.97 
 
 		 170 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  55.15 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  56.36 
 
 		 175 aa  184  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  54.12 
 
 		 175 aa  173  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  46.31 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  46.71 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  48.1 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  42.94 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  45.62 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  45.09 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  45.18 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  45.27 
 
 		 181 aa  131  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  43.84 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  39.87 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  45.18 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  41.36 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  43.12 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  41.21 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02182  shikimate kinase  40.61 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  39.13 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  39.13 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  39.13 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  40.85 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  40.34 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  41.88 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  39.75 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  40.57 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  40.51 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  39.13 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  39.13 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  40 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  41.51 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  42.17 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  41.18 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3036  shikimate kinase  42.68 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  43.53 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  41.82 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  38.61 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  40.36 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1731  shikimate kinase  44.22 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  39.16 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2745  Shikimate kinase  40.62 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.11158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  39.52 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  39.39 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  40.12 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  40.96 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  39.18 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  38.27 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  36.75 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  38.89 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  38.27 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  41.67 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  41.71 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  41.46 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  38.12 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  39.38 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  45.64 
 
 		 277 aa  116  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  40.85 
 
 		 200 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  39.18 
 
 		 196 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  40.48 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  39.04 
 
 		 197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  39.77 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  36.53 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0837  shikimate kinase  37.08 
 
 		 190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.8297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  44.85 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  40.12 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  37.97 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  35.54 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  49.32 
 
 		 458 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0490  shikimate kinase  43.31 
 
 		 224 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  40 
 
 		 184 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  38.12 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  39.39 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  39.39 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  39.39 
 
 		 209 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  39.39 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  39.39 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  35.96 
 
 		 264 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  39.39 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  39.39 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  39.39 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  40.96 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  37.58 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  37.35 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  40.74 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  38.79 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  38.55 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  38.12 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  38.79 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  38.12 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  36.02 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  39.39 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  37.72 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  41.72 
 
 		 462 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  38.41 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  37.95 
 
 		 229 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>