More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1757 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3172  hypothetical protein  68 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1091  hypothetical protein  64.85 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1177  methylation  53.95 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  46.62 
 
 		 148 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  29.58 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  28.3 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  29.86 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  27.81 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  31.33 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  30.82 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  29.05 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  29.37 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  27.86 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  28.19 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  47.83 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  29.08 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  29.25 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.77 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  42.86 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  29.08 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  46.15 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  30.5 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  27.33 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  28.06 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  58.14 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  28.06 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  30.15 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  42.65 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  29.33 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  27.01 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  27.15 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  27.15 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  27.15 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  27.15 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  41.43 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  29.08 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  27.15 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  26.95 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  47.54 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  27.15 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  40.62 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  33.7 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  45.71 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  27.61 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  29.5 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  44.44 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  26.42 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  26.43 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.38 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  26.76 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  28.87 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.3 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.62 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  62.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  29.6 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  53.66 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  26.06 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  25.53 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.06 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.53 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.1 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  28.99 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  45 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  27.89 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  41.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  52.38 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  53.66 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  46.55 
 
 		 132 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  25 
 
 		 209 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  26.03 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  25.71 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  56.1 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.59 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  25.18 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  43.14 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>