More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1729 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 964 aa  1981    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  35.77 
 
 		 800 aa  275  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  34.8 
 
 		 733 aa  264  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 1390 aa  259  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  57.4 
 
 		 572 aa  253  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 3706 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 746 aa  252  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 1654 aa  250  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 		 488 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 771 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 991 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 1093 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 1093 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  50.93 
 
 		 783 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 815 aa  228  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 1714 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 767 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 1253 aa  218  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  38.42 
 
 		 1239 aa  217  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 1676 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  49.54 
 
 		 744 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 1560 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  53.51 
 
 		 723 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  46.25 
 
 		 1210 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 1246 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 		 834 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 		 732 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 682 aa  205  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 945 aa  204  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 547 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.09 
 
 		 1248 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  44.54 
 
 		 754 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 681 aa  201  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 892 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1177 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  46.41 
 
 		 1668 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  45.27 
 
 		 1182 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 945 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 526 aa  196  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 704 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 839 aa  194  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 941 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 439 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 886 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 1051 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 2693 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  45.93 
 
 		 1663 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  50.73 
 
 		 727 aa  191  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 613 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  44.35 
 
 		 918 aa  191  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  43.08 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 932 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 788 aa  187  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 764 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 347 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 1227 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 492 aa  184  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 819 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 1183 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 912 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 913 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 215 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 674 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 551 aa  179  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 872 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 1051 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  42.74 
 
 		 676 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1289 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  43.64 
 
 		 657 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 382 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 980 aa  172  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 782 aa  171  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 1047 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 621 aa  167  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 535 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 604 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 462 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 909 aa  164  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 936 aa  161  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 924 aa  160  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 790 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 757 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 746 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 631 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 472 aa  154  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 878 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 698 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 1205 aa  151  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 1028 aa  151  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 832 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 752 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 437 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 771 aa  148  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 532 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.62 
 
 		 1021 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 648 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 813 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 856 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>