More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1707 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  63.65 
 
 		 553 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  67.99 
 
 		 558 aa  736    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  68.61 
 
 		 554 aa  745    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  62.93 
 
 		 553 aa  641    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 553 aa  1092    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  57.79 
 
 		 556 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  52.45 
 
 		 554 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  48.37 
 
 		 560 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  44.15 
 
 		 574 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  41.65 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  40.85 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  40.38 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 579 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  40.38 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  40.38 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 		 579 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  40.21 
 
 		 579 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  40.21 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 		 579 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  40.56 
 
 		 579 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 		 579 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  41.13 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  38.65 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  40.38 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  41.15 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  39 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.43 
 
 		 573 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 557 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 		 573 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 565 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 		 605 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 580 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 559 aa  359  6e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 562 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 567 aa  352  8e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.19 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  40.66 
 
 		 611 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  38.22 
 
 		 586 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  36.82 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  36.82 
 
 		 555 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 557 aa  343  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.3 
 
 		 556 aa  343  7e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  40.77 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  37.88 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.72 
 
 		 601 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 		 565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  40.62 
 
 		 606 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  40.31 
 
 		 606 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  39.35 
 
 		 569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  39.71 
 
 		 558 aa  336  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  36.15 
 
 		 553 aa  335  2e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 589 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  39.54 
 
 		 576 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 599 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 552 aa  333  5e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 558 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.84 
 
 		 555 aa  333  5e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 554 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 552 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.94 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 		 568 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 		 587 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  37 
 
 		 558 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 574 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  38.92 
 
 		 551 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.66 
 
 		 555 aa  330  5.0000000000000004e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 		 568 aa  330  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  36.46 
 
 		 553 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.44 
 
 		 588 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 		 559 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 		 552 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  38.21 
 
 		 557 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  35.56 
 
 		 553 aa  323  7e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  35.56 
 
 		 553 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 561 aa  322  8e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  35.56 
 
 		 553 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 555 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>