39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1628 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  70.41 
 
 		 425 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  909    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  30.13 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  29.78 
 
 		 407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  29.19 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  30.17 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  28.37 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  28.47 
 
 		 447 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  26.28 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  26.9 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  26.7 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  26.14 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  26.14 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  25.22 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  24.67 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  26.14 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  27.43 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  23.86 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  25.75 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  25.72 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  24.83 
 
 		 488 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  25.43 
 
 		 580 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  24.15 
 
 		 488 aa  97.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  24.24 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  33.48 
 
 		 489 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  25 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  24.28 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  24.28 
 
 		 535 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  24.28 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  23.31 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  34.21 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  22.55 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  27.84 
 
 		 618 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  25.24 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  27.68 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  21.66 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  27.73 
 
 		 266 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25.13 
 
 		 658 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  28.93 
 
 		 266 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>