More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1602 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  77.48 
 
 
301 aa  487  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3037  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.66 
 
 
305 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  75.41 
 
 
305 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.43 
 
 
305 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1712  electron transfer flavoprotein subunit alpha  77.96 
 
 
304 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.817831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2152  electron transfer flavoprotein subunit alpha  76.9 
 
 
302 aa  447  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000659142  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.97 
 
 
302 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.63 
 
 
302 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2949  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.07 
 
 
303 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1334  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.75 
 
 
303 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
304 aa  407  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3301  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.67 
 
 
304 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  40.51 
 
 
309 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.36 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.85 
 
 
317 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.15 
 
 
325 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.04 
 
 
307 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.62 
 
 
313 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  39.62 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.15 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.15 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.15 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.15 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.15 
 
 
325 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.84 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  36.84 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.84 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.37 
 
 
327 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.15 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.02 
 
 
313 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.99 
 
 
334 aa  176  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.53 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.38 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.84 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.63 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.53 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.44 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.87 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.11 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.12 
 
 
311 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.91 
 
 
307 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.62 
 
 
315 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.33 
 
 
308 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.79 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  37.79 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.8 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.62 
 
 
312 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.8 
 
 
311 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  38.8 
 
 
311 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.79 
 
 
309 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.12 
 
 
310 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.8 
 
 
311 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1419  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.37 
 
 
320 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00843459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.8 
 
 
311 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  36.42 
 
 
335 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  36.42 
 
 
335 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.13 
 
 
309 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.64 
 
 
311 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.54 
 
 
326 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.26 
 
 
308 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.91 
 
 
308 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.17 
 
 
311 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  46.22 
 
 
314 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.17 
 
 
443 aa  168  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.81 
 
 
340 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  38.49 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.38 
 
 
443 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.64 
 
 
317 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.94 
 
 
308 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.3 
 
 
309 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.76 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.62 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.35 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.87 
 
 
317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.1 
 
 
312 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.14 
 
 
309 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  44.57 
 
 
314 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.78 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.61 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.49 
 
 
311 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05770  ETF1-related  34.38 
 
 
346 aa  165  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  40.13 
 
 
314 aa  165  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.02 
 
 
315 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.01 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.78 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.86 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.94 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.22 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.47 
 
 
441 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.81 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.52 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>