More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1578 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  79.37 
 
 
475 aa  809    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  965    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  54.35 
 
 
479 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  54.01 
 
 
475 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  52.99 
 
 
477 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
484 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
474 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  50.64 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  50.85 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  50.85 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  50.85 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  50.85 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  50.64 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  50.85 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  50.64 
 
 
474 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  50.42 
 
 
474 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 
464 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  46.7 
 
 
494 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
481 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
478 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
477 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  43.13 
 
 
484 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  45.05 
 
 
477 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
473 aa  412  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  45.37 
 
 
482 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  44.15 
 
 
472 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
475 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
475 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  43.43 
 
 
475 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
490 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  45.37 
 
 
469 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  43.83 
 
 
473 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  43.39 
 
 
472 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
473 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0327  Aldehyde Dehydrogenase  46.6 
 
 
491 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
465 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  44.69 
 
 
476 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
472 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
476 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
471 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
476 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  43.98 
 
 
475 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
476 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
470 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  42.31 
 
 
475 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 
481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0247  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
477 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
477 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  41.76 
 
 
479 aa  353  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
477 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
477 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
478 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0973  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.67 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.67 
 
 
477 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
481 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
465 aa  347  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.93 
 
 
496 aa  346  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  40.81 
 
 
484 aa  346  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
464 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
477 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
477 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
477 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
473 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
477 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
477 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0638  aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
477 aa  342  8e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00666091  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  43.86 
 
 
481 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2311  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
477 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0498  aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
477 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39.29 
 
 
506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1249  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 
478 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
478 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3675  aldehyde dehydrogenase  42.82 
 
 
477 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.622193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3297  putative dehydrogenase  44.66 
 
 
478 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461732  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1720  Aldehyde Dehydrogenase  43.47 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1360  Aldehyde Dehydrogenase  43.5 
 
 
482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0897  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
479 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0403101 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
465 aa  333  6e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
465 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
483 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0959  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
487 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
465 aa  329  7e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  39.53 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.36 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  37.93 
 
 
468 aa  325  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
506 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
466 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 
490 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 
486 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3628  Aldehyde Dehydrogenase  42.41 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.94 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
484 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
480 aa  320  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>