More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1562 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1278    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  71.64 
 
 		 411 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  73.63 
 
 		 412 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  54.47 
 
 		 665 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  43.95 
 
 		 392 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  41.37 
 
 		 366 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  41.26 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  46.63 
 
 		 320 aa  163  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.7 
 
 		 758 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  26.68 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  26.98 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 769 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 797 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.04 
 
 		 377 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  50.34 
 
 		 229 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  49.66 
 
 		 222 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  32.02 
 
 		 836 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.51 
 
 		 776 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  43.2 
 
 		 229 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  41.44 
 
 		 242 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.67 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  29.02 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  41.29 
 
 		 242 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  28 
 
 		 768 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.7 
 
 		 902 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  28.5 
 
 		 788 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  46.9 
 
 		 325 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.56 
 
 		 784 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  41.28 
 
 		 250 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  26.63 
 
 		 423 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.46 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  40.31 
 
 		 239 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  27.48 
 
 		 771 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29 
 
 		 771 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  41.77 
 
 		 209 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  41.77 
 
 		 209 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  43.17 
 
 		 227 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  43.17 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  42.96 
 
 		 264 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  44.08 
 
 		 225 aa  118  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  40.91 
 
 		 238 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  30.59 
 
 		 256 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  24.37 
 
 		 763 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.94 
 
 		 802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  111  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  36.19 
 
 		 224 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  33.9 
 
 		 224 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.26 
 
 		 228 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  31.17 
 
 		 239 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  35.75 
 
 		 224 aa  107  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.25 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  34.48 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  34.25 
 
 		 236 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  34.16 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  34.25 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  34.16 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.83 
 
 		 226 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 		 224 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  34.16 
 
 		 236 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0641  iron-sulfur binding reductase  23.03 
 
 		 330 aa  104  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.65 
 
 		 229 aa  100  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 		 230 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  33.83 
 
 		 230 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  34.53 
 
 		 225 aa  97.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  39.69 
 
 		 206 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.63 
 
 		 225 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  34.64 
 
 		 220 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 		 746 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 223 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  33.17 
 
 		 258 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  27.9 
 
 		 714 aa  91.3  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  34.83 
 
 		 220 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  35.81 
 
 		 174 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  38.75 
 
 		 246 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3863  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  32.61 
 
 		 266 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  34.05 
 
 		 232 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 		 722 aa  87.8  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  35.88 
 
 		 231 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.48 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 232 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 		 713 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  29.92 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.34 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  32.86 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  28.85 
 
 		 714 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  35.47 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.32 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  30.73 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  32.37 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  37.7 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  31.79 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  30.84 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  37.8 
 
 		 207 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.63 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.93 
 
 		 238 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  34.72 
 
 		 233 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  39.13 
 
 		 149 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>