26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1551 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  37.58 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  35.76 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  31.37 
 
 		 202 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  32.45 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  30.81 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  32.39 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  31.33 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  30.72 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  31.69 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  30.94 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  26.62 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  26.16 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  29.07 
 
 		 179 aa  62  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  22.82 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  29.26 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  26.74 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  25.54 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  22.76 
 
 		 171 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  26.53 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  30.48 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  30.48 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0691  hypothetical protein  24.73 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>