More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1536 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
264 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
267 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
263 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
263 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
262 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.98 
 
 
360 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
259 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
265 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.92 
 
 
258 aa  199  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
257 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.58 
 
 
257 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
344 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.18 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
256 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
298 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  39.76 
 
 
259 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  39.76 
 
 
259 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
259 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  44.93 
 
 
261 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
343 aa  185  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
257 aa  185  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  44.17 
 
 
264 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
276 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
261 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
264 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
261 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
267 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
267 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
259 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
250 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
267 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.98 
 
 
261 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
260 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  37.3 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
259 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
261 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
258 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
265 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
259 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  36.25 
 
 
267 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.76 
 
 
265 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
257 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
266 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263195  hitchhiker  0.00574732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.97 
 
 
265 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
262 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
273 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
263 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
269 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
259 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
258 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
253 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
255 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
265 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
262 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
264 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 
321 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  34.16 
 
 
258 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
271 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
260 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
259 aa  148  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.996462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
269 aa  148  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  0.87927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.71 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.73 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  34 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
259 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  41.49 
 
 
275 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.54 
 
 
259 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
249 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 
260 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
256 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
275 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
256 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
261 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
267 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
250 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
262 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
277 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3574  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
267 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259441  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
263 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
262 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
262 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000113464  decreased coverage  0.000120518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>