More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1468 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 
93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  81.72 
 
 
93 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  81.72 
 
 
93 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  76.09 
 
 
96 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  74.73 
 
 
95 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  65.93 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  65.93 
 
 
94 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 
110 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 
106 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 
168 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 
98 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  52.17 
 
 
93 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 
100 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
101 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 
91 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
101 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
93 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 
94 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
103 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  52.75 
 
 
92 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
101 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  48.91 
 
 
110 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
94 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 
92 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
95 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  49.45 
 
 
98 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 
96 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
98 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 
95 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  47.83 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  49.46 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  50 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  50.55 
 
 
93 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
92 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 
100 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  47.83 
 
 
98 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 
94 aa  93.6  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 
102 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 
138 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>