More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1450 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  50.86 
 
 
831 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  43.48 
 
 
393 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  53.17 
 
 
425 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  53.14 
 
 
557 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  48.78 
 
 
684 aa  195  6e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  45.91 
 
 
1402 aa  194  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  47.8 
 
 
789 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  50.49 
 
 
271 aa  188  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.69 
 
 
528 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  46.61 
 
 
1493 aa  185  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  46.95 
 
 
342 aa  185  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  47.51 
 
 
489 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  46.33 
 
 
961 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  42.67 
 
 
1037 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.87 
 
 
341 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  47.29 
 
 
305 aa  175  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  46.5 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  49.05 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  44.55 
 
 
256 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  40.96 
 
 
685 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  46.5 
 
 
235 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  43.41 
 
 
838 aa  167  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 
448 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.41 
 
 
490 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  44.33 
 
 
1002 aa  166  5e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  45.5 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.41 
 
 
490 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  48.7 
 
 
2413 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.1 
 
 
318 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  47.69 
 
 
482 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.77 
 
 
267 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44 
 
 
343 aa  161  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  44.33 
 
 
1032 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  45.03 
 
 
232 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  43.66 
 
 
359 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.12 
 
 
346 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.4 
 
 
380 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  40.85 
 
 
329 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  45.7 
 
 
208 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  40.78 
 
 
373 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.55 
 
 
272 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  41.46 
 
 
976 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  42.58 
 
 
1877 aa  148  9e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  47.78 
 
 
380 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  41.71 
 
 
839 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  39.9 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  41.67 
 
 
264 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  40.29 
 
 
373 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  43.5 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
252 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.45 
 
 
380 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  39.38 
 
 
331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  39.38 
 
 
331 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  42.36 
 
 
1430 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.3 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  42.56 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  39.27 
 
 
376 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  39.27 
 
 
376 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  43.92 
 
 
731 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.54 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.28 
 
 
270 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  36.36 
 
 
1078 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  36.36 
 
 
1044 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  42 
 
 
464 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.22 
 
 
392 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  42.62 
 
 
850 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  39.71 
 
 
509 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  39.71 
 
 
509 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  39.71 
 
 
509 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  39.71 
 
 
509 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  45.95 
 
 
185 aa  131  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.14 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  43.58 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  40.78 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.93 
 
 
680 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.01 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  38.01 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.75 
 
 
865 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.02 
 
 
523 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  38.83 
 
 
415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.98 
 
 
679 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  33.01 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  44.64 
 
 
839 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  40.38 
 
 
399 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  42.49 
 
 
285 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.74 
 
 
255 aa  125  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.23 
 
 
890 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  39.32 
 
 
327 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  39.44 
 
 
552 aa  123  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  47.29 
 
 
172 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  33.92 
 
 
304 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  38.8 
 
 
763 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  31.25 
 
 
348 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  37.56 
 
 
358 aa  121  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  43.75 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.62 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>