34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1444 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1444  addiction module antitoxin  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2607  addiction module antitoxin  74.12 
 
 
86 aa  141  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1786  addiction module antitoxin  68.97 
 
 
87 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0074  addiction module toxin, Txe/YoeB family  65.52 
 
 
87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0045  addiction module toxin, Txe/YoeB family  62.07 
 
 
87 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0870  addiction module toxin, Txe/YoeB family  59.77 
 
 
87 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0995  addiction module toxin, Txe/YoeB family  59.77 
 
 
87 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000552996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2262  addiction module antitoxin  58.62 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1792  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.65 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00863649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2963  addiction module antitoxin  62.2 
 
 
82 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1546  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.19 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2483  addiction module antitoxin  38.64 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2532  addiction module antitoxin  38.64 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000423523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  35.23 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  32.22 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0231  addiction module antitoxin  40 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0726  addiction module toxin, Txe/YoeB family  31.87 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  36.11 
 
 
93 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1914  addiction module toxin, Txe/YoeB family  37.08 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2478  addiction module toxin, Txe/YoeB family  33.72 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3630  addiction module toxin, Txe/YoeB family  33.72 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0706  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.53 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0988  addiction module antitoxin  39.66 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  37.88 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  37.31 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  37.65 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  41.38 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  41.38 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  33.73 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  39.34 
 
 
87 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1523  addiction module toxin, Txe/YoeB family  36.67 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.370643  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4121  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2008  hypothetical protein  38.24 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0280496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  33.33 
 
 
233 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>