51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1419 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  88.24 
 
 		 102 aa  193  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  89.11 
 
 		 103 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  87.13 
 
 		 103 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  87.25 
 
 		 102 aa  190  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  86.27 
 
 		 102 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  85.29 
 
 		 102 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  81.19 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  81.19 
 
 		 102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  61.76 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  59.8 
 
 		 102 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  60.78 
 
 		 102 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  52.53 
 
 		 107 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  52.53 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  34.38 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  32.32 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  32.29 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  32.32 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  31.07 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  34.04 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  27.55 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  29.47 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  29.17 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  27.96 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  27.66 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  25.74 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  27 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  29.76 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  31.68 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  25.74 
 
 		 126 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  31.63 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  26.67 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  23 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  27.84 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  25 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  29.9 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>