More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1413 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
338 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  89.94 
 
 
337 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  89.94 
 
 
337 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  86.09 
 
 
338 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.76 
 
 
338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.55 
 
 
338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  83.73 
 
 
338 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.48 
 
 
341 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.7 
 
 
345 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.68 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.64 
 
 
339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.69 
 
 
334 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.69 
 
 
334 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.9 
 
 
352 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.39 
 
 
334 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.76 
 
 
351 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.29 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.67 
 
 
345 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.9 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.78 
 
 
334 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.02 
 
 
363 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.98 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.29 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.9 
 
 
334 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
334 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
334 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.68 
 
 
348 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.3 
 
 
352 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
336 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.18 
 
 
354 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.47 
 
 
355 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
334 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.86 
 
 
341 aa  455  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.97 
 
 
352 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
334 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
334 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.68 
 
 
348 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.07 
 
 
348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.4 
 
 
335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.89 
 
 
355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.43 
 
 
336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  70 
 
 
330 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.07 
 
 
348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
333 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
336 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
336 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
336 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.44 
 
 
353 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.45 
 
 
353 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.35 
 
 
338 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
333 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.56 
 
 
541 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
334 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
334 aa  447  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.68 
 
 
353 aa  448  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
333 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.19 
 
 
333 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.56 
 
 
333 aa  447  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
334 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.18 
 
 
350 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.28 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.17 
 
 
341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.35 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 
356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.36 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.55 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.74 
 
 
334 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.88 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.95 
 
 
336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.25 
 
 
333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  64.65 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.17 
 
 
334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.74 
 
 
337 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
352 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.67 
 
 
337 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.37 
 
 
355 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 
358 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.12 
 
 
336 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.76 
 
 
348 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.12 
 
 
334 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.03 
 
 
337 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.4 
 
 
356 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.71 
 
 
354 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.4 
 
 
356 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.48 
 
 
355 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.65 
 
 
351 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 
336 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.4 
 
 
355 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.4 
 
 
356 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.85 
 
 
343 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>