53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1392 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  54.55 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  55.94 
 
 
143 aa  147  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  50.35 
 
 
143 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  51.75 
 
 
143 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  43.36 
 
 
143 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  43.36 
 
 
143 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  35.92 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  34.93 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  30.99 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  31.21 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  32.41 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  31.91 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  30.99 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  32.17 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  35.34 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  28.87 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  31.91 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  33.57 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  30.2 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  32.87 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  31.91 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  32.39 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  34.27 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  29.05 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  33.57 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  27.97 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  28.87 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  29.37 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  28.39 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  26.76 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  25.87 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  28.77 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  28.37 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  24.82 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1005  protein of unknown function DUF101  31.51 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  24.48 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  26.76 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  26.24 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  24.81 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  23.4 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  30.39 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  28.46 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  30.07 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  28.08 
 
 
163 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  24.54 
 
 
159 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  20.15 
 
 
140 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  23.89 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0947  hypothetical protein  30.92 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  23.4 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>