64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1339 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  64.65 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  62.63 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  58.82 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  57.84 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  59.8 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  61.76 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  59.8 
 
 		 102 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  59.8 
 
 		 102 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  58.82 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  58.82 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  57.84 
 
 		 102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  49.5 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  45.54 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  45.54 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  34.38 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  28.42 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  36.9 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  29.52 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  27.72 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  30.21 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  27.72 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  31.52 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  27.08 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  32.97 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  29.03 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  27.17 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  27.37 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  31.07 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  25.81 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  30.11 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  27.08 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  25 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  29.21 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  29.67 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  29.55 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  26.67 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  30.61 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  30.16 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  30.16 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  31.07 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  28.09 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  27.66 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  29.79 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  24.05 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  28.72 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  26.8 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  22 
 
 		 113 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  22 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  22 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  22 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  22 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  22 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  26.6 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  29.63 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  29.03 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  28 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>