77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1273 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 303 aa  634    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  74.41 
 
 		 300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  34.85 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  30.42 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  30.85 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  28.52 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  27.97 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1104  hypothetical protein  24.91 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1091  cytosolic protein  25.27 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.726391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1278  hypothetical protein  25.56 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1208  hypothetical protein  25.93 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1115  hypothetical protein  25.93 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1097  hypothetical protein  25.56 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4092  hypothetical protein  25.93 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0910  hypothetical protein  29.17 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1354  hypothetical protein  25.19 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1316  hypothetical protein  25.19 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.895011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1249  hypothetical protein  25.19 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  28.22 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  24.04 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  25.51 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.82 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  24.89 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  29.32 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.47 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  24.77 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  26.57 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  23.93 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  22.97 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  24.89 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  26.51 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2762  hypothetical protein  29.08 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.675681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  27.62 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  23.46 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  23.9 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  23.9 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3475  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  26.51 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  26.76 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  24.75 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  24.75 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  25.87 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  24.75 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  23.64 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  23.86 
 
 		 208 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  23.44 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1677  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  26.24 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  21.93 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1578  hypothetical protein  22.61 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2376  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248957  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  24.35 
 
 		 231 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  23.85 
 
 		 245 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  23.32 
 
 		 242 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2107  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  22.61 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  25.56 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  19.9 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  22.8 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  20.89 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  34.65 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  23.32 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 220 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>