More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1150 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  100 
 
 
377 aa  752  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  73.21 
 
 
377 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  66.14 
 
 
378 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  67.64 
 
 
377 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  67.37 
 
 
377 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  66.22 
 
 
377 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  58.24 
 
 
405 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  56.46 
 
 
427 aa  407  1e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  55.59 
 
 
369 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  45.09 
 
 
377 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  43.65 
 
 
378 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  40.9 
 
 
378 aa  304  1e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 
378 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  42.41 
 
 
379 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 
376 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  46.15 
 
 
381 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  40 
 
 
375 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 
375 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  41.53 
 
 
371 aa  273  5e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  41.53 
 
 
371 aa  273  5e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  40.64 
 
 
369 aa  273  5e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 
369 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
375 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  41.42 
 
 
376 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  40.58 
 
 
378 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 
366 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  40.9 
 
 
373 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  39.57 
 
 
379 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  40 
 
 
376 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  39.57 
 
 
382 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 
380 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  40.21 
 
 
376 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
370 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 
374 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  38.61 
 
 
376 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  36.7 
 
 
377 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  40.41 
 
 
384 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 
384 aa  254  1e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 
376 aa  254  2e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  36.9 
 
 
376 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 
376 aa  253  5e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  40.26 
 
 
379 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  41.88 
 
 
377 aa  252  8e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  41.88 
 
 
377 aa  252  9e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 
376 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  40.16 
 
 
387 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  38.67 
 
 
376 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
364 aa  250  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  38.34 
 
 
376 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 
368 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  38.4 
 
 
376 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  37.82 
 
 
377 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  38.4 
 
 
376 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  38.4 
 
 
376 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  38.4 
 
 
376 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  41.44 
 
 
378 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  38.4 
 
 
391 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  38.6 
 
 
391 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  40 
 
 
381 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 
391 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 
391 aa  239  6e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 
377 aa  239  7e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
385 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
380 aa  236  5e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 
379 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  36.6 
 
 
357 aa  234  2e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 
380 aa  234  2e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  36.51 
 
 
378 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 
375 aa  232  7e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  37.76 
 
 
373 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  37.76 
 
 
373 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 
375 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  37.07 
 
 
369 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  37.33 
 
 
375 aa  229  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  36.66 
 
 
368 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 
370 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
380 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
376 aa  228  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 
1171 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  36 
 
 
375 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 
370 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  36.34 
 
 
389 aa  221  1e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
369 aa  221  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  39.9 
 
 
364 aa  220  2e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  36.6 
 
 
370 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  35.64 
 
 
368 aa  220  4e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  1.90775e-06 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 
369 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  36.77 
 
 
389 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 
389 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  32.99 
 
 
383 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 
371 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  36.63 
 
 
380 aa  217  3e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  37.27 
 
 
369 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>