149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1052 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  58.25 
 
 
625 aa  742  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17655e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  68.2 
 
 
603 aa  851  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  65.78 
 
 
623 aa  811  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  70.84 
 
 
599 aa  869  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  60.41 
 
 
607 aa  734  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
605 aa  1254  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  70.82 
 
 
598 aa  877  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  70.58 
 
 
605 aa  868  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  47.84 
 
 
639 aa  601  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  46.08 
 
 
724 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  46.4 
 
 
683 aa  583  1e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  45.71 
 
 
723 aa  583  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  45.71 
 
 
723 aa  583  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  47.24 
 
 
671 aa  584  1e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  583  1e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  45.71 
 
 
723 aa  583  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  45.71 
 
 
723 aa  583  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  45.17 
 
 
721 aa  583  1e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  45.33 
 
 
739 aa  584  1e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  45.71 
 
 
723 aa  583  1e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  47.45 
 
 
674 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  44.71 
 
 
787 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  44.71 
 
 
775 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  45.18 
 
 
739 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  46.5 
 
 
677 aa  574  1e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  47.95 
 
 
707 aa  574  1e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  47.13 
 
 
679 aa  573  1e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  49.83 
 
 
673 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  47.86 
 
 
688 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 
678 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  46.86 
 
 
622 aa  566  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  46.98 
 
 
657 aa  563  1e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  45.98 
 
 
642 aa  562  1e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 
679 aa  561  1e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  47.55 
 
 
688 aa  563  1e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  44.91 
 
 
781 aa  562  1e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  44.44 
 
 
787 aa  564  1e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  46.47 
 
 
786 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  43.99 
 
 
763 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  2.31874e-06 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  43.15 
 
 
790 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  43.16 
 
 
789 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  45.99 
 
 
777 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  45.99 
 
 
790 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  43.62 
 
 
766 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  45.89 
 
 
662 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  43.53 
 
 
766 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  45.58 
 
 
685 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  45.55 
 
 
662 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  44.07 
 
 
773 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  48.17 
 
 
598 aa  548  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  48.05 
 
 
658 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  45.91 
 
 
589 aa  542  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  48.21 
 
 
621 aa  545  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  47.6 
 
 
600 aa  545  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  45.03 
 
 
763 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  43.41 
 
 
736 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95754e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  44.01 
 
 
785 aa  541  1e-152  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  46.46 
 
 
648 aa  538  1e-152  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  43.41 
 
 
737 aa  540  1e-152  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  46.7 
 
 
648 aa  541  1e-152  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  44.2 
 
 
710 aa  540  1e-152  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  46.26 
 
 
634 aa  541  1e-152  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  45.54 
 
 
687 aa  538  1e-152  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  45.74 
 
 
612 aa  536  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 
755 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  44.71 
 
 
774 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  46.96 
 
 
640 aa  535  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  49.82 
 
 
607 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  4.09081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  46.42 
 
 
614 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  43.48 
 
 
740 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.99 
 
 
763 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  43.59 
 
 
620 aa  526  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  44.33 
 
 
630 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
567 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
567 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  46.46 
 
 
648 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 
666 aa  512  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  45.81 
 
 
740 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  41.95 
 
 
747 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  46.99 
 
 
554 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  48.06 
 
 
680 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.46 
 
 
646 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  40.85 
 
 
718 aa  497  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  45.42 
 
 
568 aa  488  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  44.37 
 
 
583 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 
746 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  43.01 
 
 
571 aa  475  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.12 
 
 
620 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 
595 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  43.18 
 
 
758 aa  339  1e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2898  radical SAM family protein  45.81 
 
 
724 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 
770 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  46.33 
 
 
806 aa  330  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  45.76 
 
 
780 aa  330  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>