79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1016 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 385 aa  791    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.72 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.5 
 
 		 371 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  44.59 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  42.7 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  43.37 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  40.8 
 
 		 371 aa  252  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.48 
 
 		 360 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  37.92 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.91 
 
 		 362 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.42 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.9 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.46 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  31.77 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.13 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.96 
 
 		 292 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.11 
 
 		 358 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 228 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.45 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.03 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.09 
 
 		 334 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  24.73 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  34.11 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  24.36 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  31.97 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 116 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  40.3 
 
 		 108 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 98 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  41.03 
 
 		 102 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.97 
 
 		 106 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  41.79 
 
 		 95 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  20.73 
 
 		 408 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.31 
 
 		 117 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  38.81 
 
 		 96 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.39 
 
 		 101 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.39 
 
 		 101 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 104 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.53 
 
 		 106 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 		 98 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  21.52 
 
 		 345 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 101 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 108 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  37.31 
 
 		 107 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.07 
 
 		 99 aa  49.7  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 		 96 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 93 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  33.33 
 
 		 119 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 		 106 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.7 
 
 		 100 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 		 95 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 95 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42 
 
 		 93 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  32.23 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.84 
 
 		 101 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 95 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.18 
 
 		 110 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.52 
 
 		 116 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.51 
 
 		 118 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.59 
 
 		 94 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 104 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  34.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1535  plasmid maintenance system antidote protein  29.21 
 
 		 123 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0393222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3311  plasmid maintenance system antidote protein  34.85 
 
 		 111 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  30.67 
 
 		 95 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 103 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.47 
 
 		 101 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.47 
 
 		 101 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  35.71 
 
 		 103 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  35.71 
 
 		 101 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  26.47 
 
 		 101 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.34 
 
 		 103 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.82 
 
 		 151 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>