More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0960 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 666 aa  1348    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  53.58 
 
 		 549 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.73 
 
 		 549 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  51.71 
 
 		 549 aa  316  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 		 540 aa  309  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 		 542 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 		 547 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.18 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 679 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.61 
 
 		 535 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.86 
 
 		 544 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.45 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.61 
 
 		 535 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 		 557 aa  298  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.34 
 
 		 542 aa  297  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 547 aa  296  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.02 
 
 		 550 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.8 
 
 		 547 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  49.71 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  43.88 
 
 		 544 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 		 544 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 671 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.93 
 
 		 549 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.53 
 
 		 538 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  52.45 
 
 		 533 aa  290  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.6 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.52 
 
 		 533 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.75 
 
 		 550 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 		 549 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.41 
 
 		 540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.74 
 
 		 540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.85 
 
 		 661 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  53 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 		 570 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  50.48 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  48.31 
 
 		 392 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 		 533 aa  279  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 		 565 aa  276  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.8 
 
 		 539 aa  275  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 		 541 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  48.57 
 
 		 528 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 		 822 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.7 
 
 		 674 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.54 
 
 		 392 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.15 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  49.21 
 
 		 632 aa  267  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 		 542 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 		 546 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  50.64 
 
 		 645 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  48.01 
 
 		 541 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 388 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 		 392 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 		 569 aa  263  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.35 
 
 		 540 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 509 aa  261  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 		 700 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.68 
 
 		 700 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 		 540 aa  256  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 		 563 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 515 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 515 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 		 533 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 		 518 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 674 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 		 518 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 		 537 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.96 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.18 
 
 		 532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 549 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 		 549 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.44 
 
 		 648 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  29.35 
 
 		 676 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 		 628 aa  225  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 670 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5093  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.36 
 
 		 676 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0789  chemotaxis sensory transducer  29.81 
 
 		 676 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5137  putative chemotaxis transducer  29.62 
 
 		 673 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 		 541 aa  203  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58650  putative chemotaxis transducer  29.24 
 
 		 673 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 		 636 aa  203  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1066  methyl-accepting chemotaxis protein  26.75 
 
 		 685 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 676 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 		 897 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  35.33 
 
 		 394 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0913  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.61 
 
 		 685 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  33.16 
 
 		 629 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 601 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 		 474 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 		 830 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 		 676 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 638 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.13 
 
 		 640 aa  194  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>