170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0943 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  789  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  67.37 
 
 
385 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  64.4 
 
 
385 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  64.1 
 
 
386 aa  506  1e-142  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  64.77 
 
 
386 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  59.03 
 
 
378 aa  439  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  41.94 
 
 
387 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  42.2 
 
 
384 aa  279  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  40.26 
 
 
404 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  40.85 
 
 
386 aa  269  6e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  7.52417e-08 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  41.06 
 
 
377 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  41.06 
 
 
377 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  41.82 
 
 
410 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  40.45 
 
 
397 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  40.38 
 
 
384 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  41.51 
 
 
394 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  38.9 
 
 
387 aa  235  1e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  1.18713e-06 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  36.76 
 
 
370 aa  213  3e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  35.73 
 
 
393 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  33.71 
 
 
370 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  35.85 
 
 
417 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  35.57 
 
 
388 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  35.77 
 
 
393 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  34.38 
 
 
380 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  31.83 
 
 
370 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  36.16 
 
 
424 aa  190  3e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  32.39 
 
 
370 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  34.75 
 
 
377 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  32.02 
 
 
370 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  34.67 
 
 
393 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  31.55 
 
 
370 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  31.74 
 
 
368 aa  185  1e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  32.77 
 
 
370 aa  185  1e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  31.74 
 
 
370 aa  184  2e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  31.74 
 
 
370 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  34.07 
 
 
394 aa  183  5e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  33.15 
 
 
370 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  32.88 
 
 
370 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  34.88 
 
 
386 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  34.62 
 
 
397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  34.75 
 
 
397 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  31.55 
 
 
370 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  31.36 
 
 
368 aa  175  1e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  32.89 
 
 
397 aa  173  4e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  35.62 
 
 
386 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  35.17 
 
 
391 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  33.89 
 
 
397 aa  165  1e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  33.8 
 
 
398 aa  164  2e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  32.69 
 
 
396 aa  162  8e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.56 
 
 
396 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  32.16 
 
 
403 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  31.07 
 
 
394 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  30.03 
 
 
395 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  156  5e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  32.49 
 
 
394 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  34.68 
 
 
398 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  33.8 
 
 
375 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  30.75 
 
 
396 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  33.8 
 
 
451 aa  154  3e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  32.42 
 
 
396 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.65 
 
 
396 aa  152  9e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  31.65 
 
 
396 aa  152  9e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  31.12 
 
 
396 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  33.52 
 
 
384 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  30.59 
 
 
397 aa  148  1e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  29.37 
 
 
395 aa  148  2e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.15 
 
 
368 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  31.4 
 
 
394 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  30.68 
 
 
394 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  30.39 
 
 
410 aa  145  8e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  30.94 
 
 
410 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  30.94 
 
 
410 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  7.10511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  30.22 
 
 
358 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  30.6 
 
 
394 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  30.94 
 
 
396 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  30.93 
 
 
404 aa  142  1e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  32.11 
 
 
394 aa  141  2e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  32.73 
 
 
360 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  32.89 
 
 
400 aa  140  5e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  31.62 
 
 
337 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  31.17 
 
 
376 aa  136  7e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  31.83 
 
 
366 aa  135  1e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  31.2 
 
 
362 aa  135  1e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  32.14 
 
 
369 aa  132  1e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  30.22 
 
 
375 aa  130  5e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  31.61 
 
 
349 aa  130  6e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  30.87 
 
 
367 aa  128  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  28.88 
 
 
396 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  30.33 
 
 
386 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  30.71 
 
 
398 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  28.57 
 
 
396 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  30.41 
 
 
375 aa  121  2e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  28.27 
 
 
396 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  28.49 
 
 
366 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  30.75 
 
 
356 aa  118  1e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  31.3 
 
 
358 aa  118  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>