29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0941 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  73.68 
 
 
363 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  66.89 
 
 
152 aa  218  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  64.9 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  30.92 
 
 
1005 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  27.5 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  28.47 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  23.57 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  28.86 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4022  Rubrerythrin  27.89 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3469e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  29.05 
 
 
994 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  27.89 
 
 
165 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  29.93 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  25 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.42 
 
 
1008 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.11 
 
 
1011 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.11 
 
 
1011 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  26 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  28 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.85 
 
 
994 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  27.4 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  23.53 
 
 
174 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  36.36 
 
 
159 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1928  rubrerythrin  25.33 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000521013  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  25.64 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  26.17 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  25.17 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  24.49 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  25.17 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>