16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0909 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  163  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  76.92 
 
 
85 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  75.64 
 
 
108 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  55.26 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000547457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  53.95 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  48.1 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  48.68 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000161134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  44.87 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  42.5 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  43.84 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  38.96 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  38.67 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>