295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0899 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.07273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  82.52 
 
 
250 aa  416  1e-115  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  80.08 
 
 
248 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  84 
 
 
253 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  79.22 
 
 
250 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.95379e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  78.78 
 
 
245 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  63.04 
 
 
259 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  67.74 
 
 
253 aa  314  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  64.08 
 
 
247 aa  310  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  60.73 
 
 
252 aa  307  1e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  65.81 
 
 
241 aa  306  2e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  65.84 
 
 
244 aa  306  2e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  64.11 
 
 
255 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.4631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  60 
 
 
250 aa  298  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  59.2 
 
 
253 aa  296  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  60.66 
 
 
248 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  59.6 
 
 
253 aa  293  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  60.24 
 
 
250 aa  291  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  61.28 
 
 
239 aa  291  5e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  60.89 
 
 
259 aa  291  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  58.51 
 
 
250 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  58.92 
 
 
249 aa  286  3e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  60.08 
 
 
295 aa  286  3e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  60.78 
 
 
238 aa  285  6e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  60.54 
 
 
264 aa  284  1e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  60.58 
 
 
251 aa  283  2e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  7.10089e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  59.52 
 
 
253 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  59.52 
 
 
253 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  59.13 
 
 
253 aa  274  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  55.42 
 
 
246 aa  273  2e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  6.14006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  59.44 
 
 
268 aa  271  8e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  58.94 
 
 
258 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  3.21183e-07  unclonable  3.29078e-08 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  60.41 
 
 
249 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  56.8 
 
 
255 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  58.65 
 
 
238 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  61.98 
 
 
249 aa  268  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  60.94 
 
 
241 aa  268  6e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  8.73859e-07 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  58.66 
 
 
254 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  57.69 
 
 
241 aa  264  9e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  56.91 
 
 
256 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  56.79 
 
 
248 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  59.34 
 
 
251 aa  261  7e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  58.8 
 
 
256 aa  261  7e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  53.41 
 
 
518 aa  261  7e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  56.22 
 
 
254 aa  261  9e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  55.78 
 
 
256 aa  261  9e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  60.19 
 
 
245 aa  260  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  53.01 
 
 
514 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  55.38 
 
 
265 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  57.08 
 
 
253 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  58.17 
 
 
253 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 
528 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  53.01 
 
 
522 aa  258  5e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  56.63 
 
 
252 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  52.4 
 
 
518 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  51.46 
 
 
242 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 
577 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 
529 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  52.97 
 
 
518 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  59.5 
 
 
248 aa  253  2e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  58.55 
 
 
238 aa  252  4e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.62 
 
 
523 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 
523 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 
523 aa  251  8e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  53.95 
 
 
529 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 
523 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  58.47 
 
 
252 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  54.66 
 
 
530 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
256 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  57.52 
 
 
238 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  58.87 
 
 
252 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  54.11 
 
 
251 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.21681e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.74889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.30968e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.9602e-05  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  53.78 
 
 
249 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.51436e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.2685e-06  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.02037e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  57.45 
 
 
237 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.83082e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.97 
 
 
519 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  52.97 
 
 
519 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  52.97 
 
 
519 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  56.22 
 
 
254 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.97 
 
 
519 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  52.97 
 
 
519 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  57.87 
 
 
237 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.96217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  9.95784e-07 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  57.87 
 
 
237 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  57.46 
 
 
528 aa  248  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  52.61 
 
 
518 aa  248  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  52.63 
 
 
527 aa  248  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  54.08 
 
 
243 aa  248  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  48 
 
 
522 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  48.4 
 
 
522 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  52.14 
 
 
518 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>