More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0894 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  70.54 
 
 
225 aa  305  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  66.36 
 
 
225 aa  290  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  57.47 
 
 
233 aa  260  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  53.05 
 
 
234 aa  241  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  53.05 
 
 
234 aa  241  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50 
 
 
231 aa  238  7e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.73 
 
 
244 aa  235  5e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  233  2e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 
253 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.14 
 
 
230 aa  231  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  53.18 
 
 
253 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  48.4 
 
 
228 aa  228  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  52.29 
 
 
242 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  51.14 
 
 
248 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50.22 
 
 
232 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
250 aa  224  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
228 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.63 
 
 
239 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.44 
 
 
235 aa  222  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  220  1e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.11 
 
 
236 aa  219  2e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.64 
 
 
235 aa  219  3e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  49.07 
 
 
244 aa  218  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.95 
 
 
244 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
220 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 
228 aa  217  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.18 
 
 
646 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.18 
 
 
237 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.1 
 
 
253 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  50.93 
 
 
228 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.32 
 
 
239 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.09 
 
 
224 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.86 
 
 
225 aa  216  3e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  48.42 
 
 
264 aa  216  3e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.73 
 
 
652 aa  216  3e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  46.82 
 
 
241 aa  216  3e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48.6 
 
 
288 aa  215  3e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  46.88 
 
 
654 aa  216  3e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  48.64 
 
 
256 aa  214  6e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
658 aa  214  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.76 
 
 
260 aa  214  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
230 aa  214  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.03 
 
 
225 aa  214  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
246 aa  214  1e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  49.54 
 
 
226 aa  213  2e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.49 
 
 
230 aa  213  2e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  2.00317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.32 
 
 
248 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.32 
 
 
248 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  47.03 
 
 
249 aa  213  2e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 
255 aa  213  2e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  47.03 
 
 
249 aa  213  3e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.58 
 
 
241 aa  213  3e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.49 
 
 
266 aa  211  5e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.36 
 
 
233 aa  211  6e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.65 
 
 
238 aa  211  8e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
220 aa  211  8e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
265 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  47.03 
 
 
249 aa  211  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.88 
 
 
225 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.69 
 
 
291 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
240 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  46.58 
 
 
241 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 
230 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  48.21 
 
 
240 aa  209  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.95 
 
 
252 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47.95 
 
 
254 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.91 
 
 
236 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
232 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.18 
 
 
252 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.09 
 
 
230 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
222 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  48.62 
 
 
233 aa  209  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.98 
 
 
226 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
231 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  46.61 
 
 
244 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 
645 aa  208  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.95 
 
 
235 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.53 
 
 
237 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  47.53 
 
 
228 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  49.06 
 
 
247 aa  207  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  47.32 
 
 
291 aa  207  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.25 
 
 
226 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.39 
 
 
239 aa  207  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
246 aa  207  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  46.64 
 
 
234 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
244 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  47.09 
 
 
228 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  45.54 
 
 
236 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.49 
 
 
648 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.49 
 
 
648 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 
240 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  3.60668e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  46.43 
 
 
235 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
228 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.49 
 
 
648 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  47.3 
 
 
276 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
233 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>