More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0815 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1036 aa  2087    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  75.56 
 
 		 1496 aa  1624    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1054 aa  754    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  40.87 
 
 		 1065 aa  811    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  43.51 
 
 		 1038 aa  789    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  44.18 
 
 		 1071 aa  877    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  42.48 
 
 		 1075 aa  837    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1054 aa  753    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  75.75 
 
 		 1041 aa  1624    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  38.84 
 
 		 1028 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1050 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  40.71 
 
 		 1054 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  42.48 
 
 		 1069 aa  832    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  42.95 
 
 		 1066 aa  832    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  42.02 
 
 		 1095 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  42.53 
 
 		 1055 aa  750    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  39.13 
 
 		 1028 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  40.12 
 
 		 1067 aa  738    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  58.08 
 
 		 1039 aa  1169    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 		 1028 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  74.95 
 
 		 1032 aa  1622    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  41.61 
 
 		 1033 aa  794    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  71.4 
 
 		 1470 aa  1498    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  42.14 
 
 		 1070 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 		 1062 aa  630  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1034 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1044 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1028 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  36.69 
 
 		 1047 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 		 1033 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1036 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1035 aa  608  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 		 1033 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  35.96 
 
 		 1073 aa  605  1.0000000000000001e-171  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 		 1044 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  36.87 
 
 		 1405 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1026 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  34.79 
 
 		 1028 aa  595  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1053 aa  593  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1044 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 		 1045 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1031 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1022 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1058 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1031 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1038 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1011 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1031 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1034 aa  568  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  37.73 
 
 		 1044 aa  569  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1043 aa  568  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1048 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.43 
 
 		 1024 aa  558  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1031 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1032 aa  556  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1064 aa  559  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1063 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1048 aa  556  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1058 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1027 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1014 aa  552  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1051 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.85 
 
 		 1068 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1039 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.24 
 
 		 1036 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1042 aa  547  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1035 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1009 aa  548  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1033 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1101 aa  548  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  33.33 
 
 		 1088 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1042 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1041 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.9 
 
 		 1049 aa  540  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1029 aa  542  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1088 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 		 1058 aa  542  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1041 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1032 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  32.35 
 
 		 1036 aa  538  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1041 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.13 
 
 		 1050 aa  537  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 		 1025 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1059 aa  536  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1031 aa  536  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1040 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1088 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1027 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1018 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1034 aa  532  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1027 aa  532  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1043 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 		 1048 aa  532  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1083 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.07 
 
 		 1032 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1043 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1046 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>