26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0809 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  43.87 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  44.27 
 
 
254 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  45.85 
 
 
253 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  43.59 
 
 
236 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  38.19 
 
 
252 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  45.24 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  45.24 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  45.24 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  33.58 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  45.99 
 
 
309 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  37.7 
 
 
261 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  32.21 
 
 
267 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  33.6 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  27.31 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  22.64 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  24.44 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  24.44 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  24.44 
 
 
265 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  25.51 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  25.53 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  20.48 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  23.27 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  24.07 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  23.04 
 
 
257 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  24.22 
 
 
252 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>