More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0781 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
393 aa  787    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  58.61 
 
 
831 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  53.41 
 
 
684 aa  354  1e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  51.62 
 
 
557 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  45.48 
 
 
489 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
448 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  50 
 
 
1402 aa  318  7e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  50.15 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  46.67 
 
 
961 aa  301  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  47.09 
 
 
685 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  44.66 
 
 
789 aa  293  5e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  40.24 
 
 
490 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.76 
 
 
490 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  47.89 
 
 
1493 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.58 
 
 
380 aa  277  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  42.9 
 
 
1037 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.67 
 
 
341 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  43.61 
 
 
1032 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  49.63 
 
 
305 aa  256  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  45.53 
 
 
380 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.03 
 
 
528 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  45.05 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  39.52 
 
 
380 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.9 
 
 
318 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  50.79 
 
 
267 aa  236  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 
976 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  40.65 
 
 
376 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  40.95 
 
 
376 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  41.08 
 
 
1002 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.59 
 
 
359 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  51.1 
 
 
2413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.51 
 
 
343 aa  220  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.4 
 
 
346 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  34.57 
 
 
509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  34.57 
 
 
509 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.99 
 
 
1877 aa  219  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  34.57 
 
 
509 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  49.57 
 
 
271 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  46.64 
 
 
416 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  34.98 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  39 
 
 
373 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  39 
 
 
373 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 
303 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.8 
 
 
680 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  39.34 
 
 
331 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  39.34 
 
 
331 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  39.34 
 
 
331 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.07 
 
 
679 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  39.81 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.57 
 
 
392 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  48.48 
 
 
256 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  48.62 
 
 
245 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  41.44 
 
 
552 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.59 
 
 
523 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  37.71 
 
 
331 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.91 
 
 
270 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  43.64 
 
 
274 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.73 
 
 
505 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.6 
 
 
865 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 
278 aa  190  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.96 
 
 
325 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  44.96 
 
 
325 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  44.96 
 
 
285 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  50.78 
 
 
235 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  44.19 
 
 
327 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.73 
 
 
272 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  48.15 
 
 
232 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  39.66 
 
 
325 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  48.21 
 
 
255 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  44.44 
 
 
838 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34.43 
 
 
348 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
1430 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.19 
 
 
316 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.54 
 
 
798 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  40.98 
 
 
264 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  36.27 
 
 
850 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.18 
 
 
358 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  44.03 
 
 
482 aa  176  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  40.77 
 
 
329 aa  176  8e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.31 
 
 
342 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  48.68 
 
 
252 aa  173  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  36.16 
 
 
1281 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  36.77 
 
 
940 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.5 
 
 
890 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  51.74 
 
 
172 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 
254 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.91 
 
 
512 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  36.9 
 
 
961 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  33.6 
 
 
591 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  41.2 
 
 
301 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  43.84 
 
 
839 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  46.33 
 
 
208 aa  161  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.45 
 
 
303 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  32.93 
 
 
1141 aa  159  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  46.59 
 
 
241 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.94 
 
 
693 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 
293 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  39.91 
 
 
315 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.66 
 
 
971 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>